Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab6aP35279 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab6aP35279 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms