Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gsx2P31316 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gsx2P31316 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms