Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa10P31310 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa10P31310 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms