Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnnd1P30999 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnnd1P30999 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnd1P30999 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms