Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
H2afxP27661 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afxP27661 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afxP27661 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2afxP27661 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afxP27661 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2afxP27661 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms