Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmo2P25801 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmo2P25801 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmo2P25801 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms