Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Myf5P24699 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Myf5P24699 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Myf5P24699 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myf5P24699 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Myf5P24699 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myf5P24699 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myf5P24699 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Myf5P24699 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Myf5P24699 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Myf5P24699 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms