Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P18528 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P18528 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P18528 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18528 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18528 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18528 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18528 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18528 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18528 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18528 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P18528 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18528 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18528 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18528 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18528 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18528 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18528 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18528 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18528 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18528 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18528 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18528 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18528 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P18528 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18528 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms