Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spi1P17433 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Spi1P17433 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spi1P17433 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spi1P17433 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms