Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcna3P16390 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcna3P16390 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcna3P16390 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcna3P16390 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcna3P16390 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcna3P16390 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcna3P16390 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcna3P16390 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcna3P16390 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcna3P16390 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcna3P16390 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.9 ms