Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim30aP15533 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30aP15533 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30aP15533 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms