Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fgf4P11403 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fgf4P11403 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms