Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Prm2P07978 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Prm2P07978 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms