Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc1P02468 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Lamc1P02468 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lamc1P02468 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms