Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01674 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01674 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01674 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01674 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01674 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01674 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01674 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01674 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01674 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01674 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01674 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01674 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01674 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01674 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01674 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01674 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01674 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01674 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01674 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01674 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01674 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01674 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01674 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01674 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01674 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01674 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01674 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01674 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01674 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01674 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01674 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01674 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01674 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01674 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms