Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FosP01101 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FosP01101 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FosP01101 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FosP01101 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FosP01101 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FosP01101 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FosP01101 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FosP01101 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FosP01101 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FosP01101 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FosP01101 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FosP01101 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FosP01101 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FosP01101 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FosP01101 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FosP01101 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FosP01101 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FosP01101 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FosP01101 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FosP01101 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FosP01101 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FosP01101 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FosP01101 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FosP01101 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FosP01101 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FosP01101 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FosP01101 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FosP01101 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FosP01101 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FosP01101 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FosP01101 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FosP01101 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FosP01101 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FosP01101 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FosP01101 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FosP01101 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FosP01101 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FosP01101 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FosP01101 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FosP01101 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FosP01101 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FosP01101 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FosP01101 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FosP01101 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FosP01101 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FosP01101 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FosP01101 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FosP01101 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FosP01101 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FosP01101 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FosP01101 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FosP01101 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FosP01101 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FosP01101 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms