Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spsb2O88838 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spsb2O88838 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms