Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cops3O88543 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cops3O88543 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms