Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lnx1O70263 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lnx1O70263 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lnx1O70263 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms