Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dsg2O55111 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dsg2O55111 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms