Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2f6O54917 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2f6O54917 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f6O54917 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms