Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Chil3O35744 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chil3O35744 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chil3O35744 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chil3O35744 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chil3O35744 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chil3O35744 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms