Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TnxbO35452 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnxbO35452 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TnxbO35452 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms