Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd9O35177 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd9O35177 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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