Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CckarO08786 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CckarO08786 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckarO08786 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckarO08786 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckarO08786 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckarO08786 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckarO08786 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckarO08786 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CckarO08786 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckarO08786 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CckarO08786 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CckarO08786 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckarO08786 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckarO08786 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckarO08786 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckarO08786 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckarO08786 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckarO08786 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckarO08786 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckarO08786 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CckarO08786 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckarO08786 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckarO08786 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckarO08786 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckarO08786 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckarO08786 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckarO08786 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckarO08786 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckarO08786 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms