Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efna3O08545 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna3O08545 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efna3O08545 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efna3O08545 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna3O08545 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms