Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm21900J3QP38 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21900J3QP38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms