Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pcdh9F8VPK8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcdh9F8VPK8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pcdh9F8VPK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms