Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep350E9Q309 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep350E9Q309 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep350E9Q309 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms