Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2610021A01RikE9Q0Q3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms