Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ptprz1B9EKR1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ptprz1B9EKR1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms