Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf11bB4XVQ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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