Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prr29B1ARI9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prr29B1ARI9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prr29B1ARI9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms