Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pm20d2A3KG59 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pm20d2A3KG59 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pm20d2A3KG59 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms