Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hacd4A2AKM2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms