Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm13941A2AJ38 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm13941A2AJ38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm13941A2AJ38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms