Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a3A2ACT7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a3A2ACT7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col9a3A2ACT7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms