Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdc27A2A6Q5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdc27A2A6Q5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms