Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.9 ms