Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVQ0

Prss47, Protease, serine 47, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss47A0A0N4SVQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prss47A0A0N4SVQ0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prss47A0A0N4SVQ0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms