Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trbv30A0A0B4J1P1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trbv30A0A0B4J1P1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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