Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms