Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec2Q9WV35 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec2Q9WV35 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec2Q9WV35 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms