Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gabbr1Q9WV18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabbr1Q9WV18 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabbr1Q9WV18 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms