Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cited4Q9WUL8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cited4Q9WUL8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms