Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cry2Q9R194 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cry2Q9R194 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cry2Q9R194 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms