Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK8

Nmu, Neuromedin-U, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmuQ9QXK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NmuQ9QXK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NmuQ9QXK8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NmuQ9QXK8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms