Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dkk3Q9QUN9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dkk3Q9QUN9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dkk3Q9QUN9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms