Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PnkpQ9JLV6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PnkpQ9JLV6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms