Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col5a3Q9JLI2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms